MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori 26695 chromosome

Total Repeats: 34855

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018939	CAT	2	6	185	190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018939	T	6	6	190	195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018939	TGAG	2	8	233	240	25 %	25 %	50 %	0 %	410681523
4	NC_018939	CATT	2	8	320	327	25 %	50 %	0 %	25 %	410681523
5	NC_018939	GAT	3	9	328	336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410681523
6	NC_018939	T	6	6	465	470	0 %	100 %	0 %	0 %	410681523
7	NC_018939	AAAGCG	2	12	494	505	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410681523
8	NC_018939	GTTG	2	8	507	514	0 %	50 %	50 %	0 %	410681523
9	NC_018939	T	7	7	524	530	0 %	100 %	0 %	0 %	410681523
10	NC_018939	T	7	7	552	558	0 %	100 %	0 %	0 %	410681523
11	NC_018939	TTC	2	6	562	567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410681523
12	NC_018939	ACA	2	6	588	593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410681523
13	NC_018939	C	6	6	606	611	0 %	0 %	0 %	100 %	410681523
14	NC_018939	CAA	2	6	662	667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410681524
15	NC_018939	C	6	6	848	853	0 %	0 %	0 %	100 %	410681524
16	NC_018939	CT	3	6	897	902	0 %	50 %	0 %	50 %	410681524
17	NC_018939	AAT	2	6	903	908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410681524
18	NC_018939	TAAAA	2	10	914	923	80 %	20 %	0 %	0 %	410681524
19	NC_018939	CTT	2	6	1006	1011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410681524
20	NC_018939	TCTG	2	8	1016	1023	0 %	50 %	25 %	25 %	410681524
21	NC_018939	TGA	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410681524
22	NC_018939	AAAT	2	8	1118	1125	75 %	25 %	0 %	0 %	410681525
23	NC_018939	AAC	2	6	1230	1235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410681525
24	NC_018939	CCG	3	9	1249	1257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410681525
25	NC_018939	CCA	2	6	1393	1398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410681525
26	NC_018939	GCT	2	6	1418	1423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410681525
27	NC_018939	CA	3	6	1432	1437	50 %	0 %	0 %	50 %	410681525
28	NC_018939	T	6	6	1449	1454	0 %	100 %	0 %	0 %	410681525
29	NC_018939	TC	3	6	1491	1496	0 %	50 %	0 %	50 %	410681525
30	NC_018939	T	6	6	1553	1558	0 %	100 %	0 %	0 %	410681525
31	NC_018939	GGC	2	6	1609	1614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410681525
32	NC_018939	GCTT	2	8	1661	1668	0 %	50 %	25 %	25 %	410681525
33	NC_018939	CT	3	6	1767	1772	0 %	50 %	0 %	50 %	410681525
34	NC_018939	TAAAA	2	10	1807	1816	80 %	20 %	0 %	0 %	410681525
35	NC_018939	GTT	2	6	1829	1834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410681525
36	NC_018939	CTT	2	6	1863	1868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410681525
37	NC_018939	A	7	7	1983	1989	100 %	0 %	0 %	0 %	410681526
38	NC_018939	ATTATA	2	12	2001	2012	50 %	50 %	0 %	0 %	410681526
39	NC_018939	CCTG	2	8	2016	2023	0 %	25 %	25 %	50 %	410681526
40	NC_018939	ATG	2	6	2029	2034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410681526
41	NC_018939	CCAA	2	8	2040	2047	50 %	0 %	0 %	50 %	410681526
42	NC_018939	ATTC	2	8	2057	2064	25 %	50 %	0 %	25 %	410681526
43	NC_018939	TGAA	2	8	2080	2087	50 %	25 %	25 %	0 %	410681526
44	NC_018939	GTT	2	6	2103	2108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410681526
45	NC_018939	GC	3	6	2118	2123	0 %	0 %	50 %	50 %	410681526
46	NC_018939	T	6	6	2182	2187	0 %	100 %	0 %	0 %	410681526
47	NC_018939	CTT	2	6	2192	2197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410681526
48	NC_018939	TGG	2	6	2249	2254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410681526
49	NC_018939	TCA	2	6	2257	2262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410681526
50	NC_018939	G	6	6	2395	2400	0 %	0 %	100 %	0 %	410681526
51	NC_018939	CA	3	6	2481	2486	50 %	0 %	0 %	50 %	410681526
52	NC_018939	ATTC	2	8	2555	2562	25 %	50 %	0 %	25 %	410681526
53	NC_018939	GTTT	2	8	2633	2640	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018939	A	8	8	2747	2754	100 %	0 %	0 %	0 %	410681527
55	NC_018939	TCTT	2	8	2763	2770	0 %	75 %	0 %	25 %	410681527
56	NC_018939	T	7	7	2843	2849	0 %	100 %	0 %	0 %	410681527
57	NC_018939	TGA	2	6	2868	2873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410681527
58	NC_018939	T	7	7	2885	2891	0 %	100 %	0 %	0 %	410681527
59	NC_018939	AGC	2	6	2983	2988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410681527
60	NC_018939	GC	3	6	2996	3001	0 %	0 %	50 %	50 %	410681527
61	NC_018939	A	6	6	3034	3039	100 %	0 %	0 %	0 %	410681527
62	NC_018939	AG	3	6	3153	3158	50 %	0 %	50 %	0 %	410681527
63	NC_018939	GTG	2	6	3172	3177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410681527
64	NC_018939	CAAA	2	8	3306	3313	75 %	0 %	0 %	25 %	410681527
65	NC_018939	GTG	2	6	3331	3336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410681527
66	NC_018939	GCC	2	6	3338	3343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410681527
67	NC_018939	TTG	2	6	3422	3427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410681528
68	NC_018939	AG	3	6	3433	3438	50 %	0 %	50 %	0 %	410681528
69	NC_018939	GAA	2	6	3454	3459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410681528
70	NC_018939	GAAA	2	8	3528	3535	75 %	0 %	25 %	0 %	410681528
71	NC_018939	GTT	2	6	3784	3789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410681528
72	NC_018939	CA	3	6	3981	3986	50 %	0 %	0 %	50 %	410681528
73	NC_018939	A	6	6	4022	4027	100 %	0 %	0 %	0 %	410681528
74	NC_018939	CAG	2	6	4030	4035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410681528
75	NC_018939	A	6	6	4072	4077	100 %	0 %	0 %	0 %	410681528
76	NC_018939	ATT	2	6	4112	4117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410681528
77	NC_018939	TGT	2	6	4123	4128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410681528
78	NC_018939	TGG	2	6	4181	4186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410681528
79	NC_018939	GGT	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018939	TAT	2	6	4339	4344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018939	TGG	2	6	4382	4387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018939	ATGC	2	8	4486	4493	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_018939	TGG	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018939	GTG	2	6	4618	4623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018939	ACC	2	6	4650	4655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_018939	GGT	2	6	4663	4668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018939	T	8	8	4802	4809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018939	AAT	2	6	4823	4828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018939	TAAA	2	8	4891	4898	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018939	A	6	6	4896	4901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018939	TAT	2	6	4959	4964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410681529
92	NC_018939	T	7	7	4964	4970	0 %	100 %	0 %	0 %	410681529
93	NC_018939	A	6	6	4979	4984	100 %	0 %	0 %	0 %	410681529
94	NC_018939	TTA	2	6	5014	5019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410681529
95	NC_018939	T	7	7	5031	5037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018939	A	6	6	5042	5047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018939	A	6	6	5058	5063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018939	TTTTA	2	10	5116	5125	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018939	A	6	6	5167	5172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018939	A	7	7	5181	5187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018939	A	8	8	5198	5205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018939	TCGC	2	8	5377	5384	0 %	25 %	25 %	50 %	410681530
103	NC_018939	ATTC	2	8	5406	5413	25 %	50 %	0 %	25 %	410681530
104	NC_018939	CATT	2	8	5450	5457	25 %	50 %	0 %	25 %	410681530
105	NC_018939	ATT	2	6	5472	5477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410681530
106	NC_018939	C	6	6	5535	5540	0 %	0 %	0 %	100 %	410681530
107	NC_018939	TGG	2	6	5570	5575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410681530
108	NC_018939	A	7	7	5682	5688	100 %	0 %	0 %	0 %	410681530
109	NC_018939	ATA	2	6	5691	5696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410681530
110	NC_018939	TCT	2	6	5709	5714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410681530
111	NC_018939	T	6	6	5714	5719	0 %	100 %	0 %	0 %	410681530
112	NC_018939	A	6	6	5724	5729	100 %	0 %	0 %	0 %	410681530
113	NC_018939	GTT	2	6	5772	5777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410681530
114	NC_018939	TAA	2	6	5841	5846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410681530
115	NC_018939	TTA	2	6	5899	5904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410681530
116	NC_018939	GTG	2	6	5968	5973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410681530
117	NC_018939	GTT	2	6	5988	5993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410681530
118	NC_018939	GC	3	6	6030	6035	0 %	0 %	50 %	50 %	410681530
119	NC_018939	CAA	2	6	6036	6041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410681530
120	NC_018939	TTGAT	2	10	6052	6061	20 %	60 %	20 %	0 %	410681530
121	NC_018939	C	6	6	6134	6139	0 %	0 %	0 %	100 %	410681530
122	NC_018939	AGT	2	6	6200	6205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410681530
123	NC_018939	T	6	6	6240	6245	0 %	100 %	0 %	0 %	410681530
124	NC_018939	GCTTGC	2	12	6274	6285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410681530
125	NC_018939	CAG	2	6	6320	6325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410681530
126	NC_018939	GTT	2	6	6372	6377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410681530
127	NC_018939	AC	3	6	6459	6464	50 %	0 %	0 %	50 %	410681530
128	NC_018939	CTT	2	6	6566	6571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410681530
129	NC_018939	TAG	8	24	6593	6616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410681530
130	NC_018939	TTA	2	6	6625	6630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410681530
131	NC_018939	TGT	2	6	6645	6650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410681530
132	NC_018939	TTG	2	6	6717	6722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410681530
133	NC_018939	GTT	2	6	6786	6791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410681530
134	NC_018939	CCG	2	6	6920	6925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410681530
135	NC_018939	T	6	6	6968	6973	0 %	100 %	0 %	0 %	410681530
136	NC_018939	ATCG	2	8	7008	7015	25 %	25 %	25 %	25 %	410681530
137	NC_018939	GCT	2	6	7035	7040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410681530
138	NC_018939	CGTT	2	8	7043	7050	0 %	50 %	25 %	25 %	410681530
139	NC_018939	TTGA	2	8	7056	7063	25 %	50 %	25 %	0 %	410681530
140	NC_018939	GTT	2	6	7065	7070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410681530
141	NC_018939	T	6	6	7116	7121	0 %	100 %	0 %	0 %	410681530
142	NC_018939	A	6	6	7182	7187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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413	NC_018939	ATG	2	6	20276	20281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410681541
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453	NC_018939	AAC	2	6	22331	22336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410681543
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465	NC_018939	TTTA	2	8	22777	22784	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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